نشأ هذا القسم الجديد إلى جانب قسم الأخرى تلبية لحاجة السوق الفلسطينية، وقد نشأت الحاجة لقسم الاقتصاد بعد قدوم السلطة الوطنية وما تبعها من تغيرات هيكلية في حاجة السوق الفلسطيني بسبب نشوء المؤسسات العامة للدولة كالوزارات والمؤسسات المختلفة التي تحتاج إلى خريجي الاقتصاد. وقد جاء قرار إنشاء هذا القسم تلبية لحاجة السوق وتلبية لتطلعات الطلبة، ومحافظة على مصلحة الخريجين وقدرتهم على الحصول على فرص العمل بعد التخرج.
ومن الملاحظ أن انشاء"قسم الاقتصاد " قد أحدث نقلة نوعية سواء في عدد الطلاب المنتسبين إليه أو من خلال عدد الخريجين الذين انخرطوا للعمل في السوق الفلسطينية.
وقد تم وضع أهداف البرنامج وفلسفته انطلاقا من أهداف كلية التجارة وفلسفتها وأهداف الجامعة الرئيسية من خلال مجلس قسم الاقتصاد و مجلس كلية التجارة.
وتتضح هذه الأهداف من موقع الكلية الإلكتروني والنظام الأكاديمي 2010/2011  والذي تعطى نسخة منه لجميع الطلبة المقبولين في الكلية. ويتم مراجعة أهداف البرنامج  في جلسات مجلس القسم، ويتم مقارنتها بمثيلاتها محلياً وعالمياً للتأكد من مواكبة البرنامج للتطور العلمي المتسارع وحاجة سوق العمل المحلي.
ويساعد المنهاج في الوصول إلى هذه الأهداف وذلك من خلال دراسة الطلبة لمجموعة من المساقات المختلفة التي تنمي جميع الجوانب المطلوبة بما في ذلك القدرات اللغوية والقيم الاجتماعية ومبادئ المعرفة التخصصية، وكذلك المهارات العملية اللازمة للخريج، ويتضح ذلك من خلال المنهاج الذي يدرسه الطالب

وبناءً عليه فإن رسالة البرنامج:
تقديم برنامج أكاديمي مميز في العلوم الاقتصادية لرفد المجتمع بالكفاءات العلمية القادرة على المساهمة في رقي الإنسان والوطن، وتحقيق أهداف المجتمع الاقتصادية في إطار القيم الوطنية والإسلامية