عقدت كلية التجارة العديد من المؤتمرات وهي كالتالي:
المؤتمر الأول: الاستثمار والتمويل في فلسطين بين آفاق التنمية والتحديات المعاصرة والمنعقد يومي 8-9/مايو/2005
المؤتمر الثاني: تنمية وتطوير قطاع غزة بعد الانسحاب الإسرائيلي المنعقد خلال الفترة من 13-15/فبراير/ 2006
المؤتمر الثالث: رؤية تنموية لمواجهة آثار الحرب والحصار على قطاع غزة المنعقد يومي الأحد والإثنين الموافق 23، 24/05/2010م
المؤتمر الرابع: الشباب والتنمية في فلسطين مشاكل وحلول والمنعقد خلال الفترة 24-25 ابرايل 2012م.
المؤتمر الخامس: الريادة والإبداع في تطوير الاعمال الصغيرة والمنعقد خلال الفترة 05-06 مايو 2015م.